MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosarcina mazei Go1 chromosome

Total Repeats: 24421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003901	GATTTT	3	18	35	52	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003901	CAA	2	6	161	166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_003901	GAT	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003901	TAT	2	6	219	224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003901	CATT	2	8	256	263	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_003901	TA	4	8	272	279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003901	A	6	6	317	322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003901	ATAATT	2	12	330	341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003901	GTA	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003901	TAA	2	6	422	427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003901	A	6	6	426	431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003901	AGG	2	6	434	439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003901	CAG	2	6	459	464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_003901	AAT	2	6	482	487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003901	AGC	2	6	497	502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_003901	ATT	2	6	507	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003901	TTCA	2	8	2194	2201	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_003901	ATA	2	6	2267	2272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003901	A	6	6	2272	2277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003901	T	6	6	2283	2288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003901	A	6	6	2307	2312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003901	A	6	6	2403	2408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003901	ATT	2	6	2476	2481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003901	A	6	6	2483	2488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003901	TAA	2	6	2556	2561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003901	AGG	2	6	2565	2570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003901	TCTG	2	8	2598	2605	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_003901	ATT	2	6	2632	2637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003901	TAT	2	6	2640	2645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003901	A	7	7	4293	4299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003901	ATA	2	6	4548	4553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003901	AAT	2	6	4565	4570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003901	AAGT	2	8	4575	4582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003901	TTA	2	6	4583	4588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003901	AAT	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003901	AGG	2	6	5617	5622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003901	TGA	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003901	T	6	6	8153	8158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003901	T	7	7	8162	8168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_003901	TACAG	2	10	9426	9435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_003901	TCTT	2	8	9438	9445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_003901	AT	3	6	9499	9504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003901	TAT	3	9	9502	9510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003901	GCA	3	9	9533	9541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_003901	TAA	2	6	9574	9579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003901	AAG	2	6	9598	9603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003901	AAT	2	6	10920	10925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003901	TAT	2	6	10926	10931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003901	AATAA	2	10	10939	10948	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003901	A	7	7	10968	10974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003901	TAG	2	6	10984	10989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003901	CTG	2	6	11302	11307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_003901	AGTAA	2	10	11415	11424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_003901	GTG	2	6	11444	11449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003901	AATAA	2	10	11450	11459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003901	TAA	2	6	11527	11532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003901	CTGTA	2	10	11581	11590	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_003901	TTA	2	6	11614	11619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003901	GCA	2	6	11643	11648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_003901	CTT	2	6	11676	11681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_003901	A	6	6	11816	11821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003901	CATGG	2	10	11837	11846	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_003901	AT	3	6	11876	11881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003901	A	6	6	11931	11936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003901	T	6	6	12001	12006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003901	CTT	2	6	12052	12057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_003901	GAA	2	6	12150	12155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003901	GAA	2	6	12176	12181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003901	CAA	2	6	12282	12287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_003901	AGT	2	6	12301	12306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003901	ATA	2	6	12324	12329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003901	AAG	2	6	12355	12360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003901	A	6	6	12389	12394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003901	GA	3	6	12410	12415	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003901	GGT	2	6	12422	12427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003901	A	7	7	12488	12494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003901	GAA	2	6	12498	12503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003901	CAG	2	6	12535	12540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_003901	AAGA	2	8	12555	12562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003901	TTC	2	6	12569	12574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_003901	TTA	2	6	12622	12627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003901	GAA	2	6	12642	12647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003901	A	6	6	12741	12746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003901	A	6	6	13170	13175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003901	TGG	2	6	13178	13183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003901	TTA	2	6	13226	13231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003901	CTT	2	6	13241	13246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_003901	TTA	2	6	13261	13266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003901	T	6	6	13276	13281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003901	ATTT	2	8	13283	13290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_003901	TTTG	2	8	13304	13311	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003901	T	7	7	13317	13323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003901	TCA	2	6	13330	13335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_003901	T	7	7	13337	13343	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003901	TCA	2	6	13350	13355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_003901	T	7	7	13357	13363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003901	AT	3	6	13364	13369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003901	T	6	6	13430	13435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003901	TAT	2	6	13462	13467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003901	T	6	6	13467	13472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_003901	ATG	2	6	13500	13505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003901	TTC	2	6	13594	13599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_003901	AGAA	2	8	13624	13631	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003901	ATC	2	6	13632	13637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_003901	AAC	2	6	13654	13659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_003901	AAT	2	6	13685	13690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003901	GAAAA	2	10	13801	13810	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003901	GCAG	2	8	13830	13837	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_003901	ATGGG	2	10	13863	13872	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003901	GCG	2	6	13888	13893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_003901	GCT	2	6	13909	13914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_003901	TAG	2	6	13956	13961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003901	TAA	2	6	13974	13979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003901	T	6	6	14002	14007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003901	GAAA	2	8	14324	14331	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003901	A	6	6	14329	14334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003901	CCT	2	6	14354	14359	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_003901	A	6	6	14390	14395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003901	GA	3	6	14424	14429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003901	A	6	6	14429	14434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003901	TTG	2	6	14811	14816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003901	GCCT	2	8	14819	14826	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_003901	A	6	6	14855	14860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003901	GAA	2	6	14865	14870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003901	CA	3	6	14983	14988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_003901	AAT	2	6	14996	15001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003901	TAC	2	6	15050	15055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_003901	TA	3	6	15098	15103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003901	AAT	2	6	15676	15681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003901	T	7	7	15710	15716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003901	T	6	6	15757	15762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003901	AT	3	6	15768	15773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003901	TCT	2	6	15780	15785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_003901	TGT	2	6	15825	15830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003901	TTAT	2	8	15847	15854	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003901	CAG	2	6	15993	15998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_003901	AAT	2	6	16002	16007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003901	AATAGG	2	12	16041	16052	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003901	T	7	7	16062	16068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003901	ATA	2	6	16082	16087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003901	TAT	2	6	16577	16582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003901	T	7	7	16751	16757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003901	TTCA	2	8	17398	17405	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_003901	TA	4	8	17456	17463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003901	TG	3	6	17478	17483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003901	ATAA	2	8	17487	17494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003901	TAA	2	6	17504	17509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003901	CAAA	2	8	17568	17575	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_003901	GC	3	6	17649	17654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_003901	TTGT	2	8	17798	17805	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003901	TTTCT	2	10	17830	17839	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_003901	T	7	7	17842	17848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003901	TC	4	8	17852	17859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_003901	TAT	2	6	18023	18028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_003901	CTG	2	6	18040	18045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_003901	AG	3	6	18146	18151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_003901	T	7	7	18157	18163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_003901	TGT	2	6	18194	18199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_003901	TTA	2	6	18231	18236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_003901	TCTTT	2	10	18582	18591	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_003901	TGA	2	6	18637	18642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_003901	AGG	2	6	18733	18738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
168	NC_003901	AAGA	2	8	18768	18775	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_003901	A	6	6	19154	19159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_003901	TGC	2	6	19206	19211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_003901	A	6	6	19275	19280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_003901	ATT	2	6	19295	19300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_003901	T	7	7	19308	19314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_003901	AT	3	6	19317	19322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_003901	CGG	2	6	19332	19337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_003901	A	6	6	19394	19399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_003901	GTT	2	6	19494	19499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_003901	TTAT	2	8	19741	19748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_003901	CTT	2	6	20612	20617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_003901	T	6	6	20808	20813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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275	NC_003901	TTA	2	6	28798	28803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_003901	CGG	2	6	30273	30278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_003901	CATA	2	8	30484	30491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
294	NC_003901	TTC	2	6	30503	30508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_003901	CTA	2	6	30512	30517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_003901	TTA	2	6	57705	57710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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